植物资源
三亚市植物资源较为丰富，截至2016年底，境内有植物种类1838种（含栽培品种516个），其中蕨类有22科72种，裸子植物7科26种，被子植物98科1740种；在被子植物中，有双子叶植物1341种，单子叶植物399种。
动物资源
三亚市境内野生动物资源较丰富，有关调查资料显示，截至2016年底，境内分布的陆生野生动物多达300余种，其中兽类50种，鸟类300余种，属国家重点保护的野生动物有云豹、孔雀雉、海南山鹧鸪、白鹇、蓝背八色鸫、黄嘴白鹭、穿山甲、猕猴、水鹿、黑熊、小灵猫、水獭、海南兔等。
海洋资源
三亚境内海岸线长度209.1千米，有19个港湾，大小岛屿40个。海洋生物种类繁多，有鱼类1064种，虾类350种，蟹类325种，软体动物700种，其中经济价值较高的有402种，鲨鱼翅、海参、石斑鱼被誉为“崖州三珍“。珊瑚保护区面积85平方千米。
水资源
三亚市地表水资源多年平均降雨深度604毫米，半径流系数0.43，年总径流量11.5亿立方米，半径深度604毫米，半径流系数0.43，年总径流量11.5亿立方米，丰水年（P=10%）的年径流量18.2亿立方米，平水年（P=50%）的年径流量10.8亿立方米，枯水年（P=90%）的年径流量5.8亿立方米。集雨面积1905平方千米，多年平均降雨量1417毫米。从保亭县流入藤桥镇的年径流量为平水年4.576亿立方米，枯水年径流量2.288亿立方米；从乐东县、保亭县流入崖城镇的年径流量为平水年1.671亿立方米，枯水年年径流量0.794亿立方米。降水量西部比东部少，径流分布自内地向沿海递减。
矿产资源
截至2015年底，三亚市境内矿产资源有29种，其中金属矿产11种，非金属矿产14种，能源矿产1种，水气矿产3种，以建材非金属矿产颇具优势。开发利用的矿产有：铁、磷、钛、石灰石、石英砂、大理石、花岗石、水晶、金、建筑石料等10种。其中石灰石、石英砂、花岗岩储量均在亿吨以上，磷、钛、铜、铁等矿品极优，金矿品位最高达每吨12.2克。三亚附近海域蕴藏着丰富的石油资源，南海天然气资源约占全国天然气贮量的1/3，现已探明崖13—1和崖13-2两口高产天然气流井。前井日产天然气120万立方米，后井日产天然气25万立方米。据估计，天然气储量约340-1182亿立方米，可采量519.88亿立方米。井年产量可达50亿立方米，可供气15-30年。
