矿产资源
福州较特殊的区域地质，形成了独特的矿种结构。已探明的地下矿产资源近四十种，以建材原料非金属矿为主，叶蜡石、标准砂、型砂、建筑砂、饰面用花岗石、高岭土、明矾石等储量多、品位高、分布广、埋藏浅，具有相当大的经济价值和开采前景。其中，叶蜡石的保有储量居中国首位；可广泛用于工业生产，且是工艺美术制品的重要原料。市郊的寿山石从南朝开始用于工艺雕刻。
植物资源
福州市林地面积7792平方千米，占全市总面积的65%，现有森林总面积947万亩，林木总蓄积量1680万立方米，森林覆盖率57.8%，绿化程度达88.6%。
福州地区维管束木本植物， 共有109科、428属、945种。及亚变种，约占全省木本植物总种数（1900余 种）的48%，种类不少，但资源量不大。在树种结构上，针叶林明显多于阔叶林，两者大致为75∶25。针叶树中以马尾松和杉木为主，其中马尾松尤为突出。 阔叶树中以壳斗科为主，如米槠、苦槠、甜槠、栲等，其次为樟科，如樟、楠等。桑科榕树分布也较普遍。
地热资源
福州市市区地热总储量达9800立方米，是中国三大温泉区之一。福州盆地的地热田是福建省最大的地热田，其泉脉广、温度高、水质优、流量大、埋藏浅，且分布在市区中心。
水资源
福州市水资源十分丰富。闽江是全省最大的水系，发源于武夷山脉，在水口镇流入福州境内；自西北向东南流经闽清、闽侯、市区、长乐，分别从长门水道和梅花港水道注入东海。闽江全长530千米，在福州境内150千米；流域面积60992平方千米，在福州市境内8011.27平方千米。境内主要支流有安仁溪、梅溪、大樟溪、大目溪、新店溪、营前溪等。福州市区水道密布，主要有晋安河、白马河、光明港、安泰河等30多条内河，都与闽江沟通，水质良好。此外，连江县的主要水系是鳌江；福清市的主要水系是龙江。
福州市本地产水资源为101.59亿立方米，入境客水量达546.9亿立方米，总计水资源量为666.49亿立方米，人均水资源高达1.25万立方米。
海洋资源
福州市海域总面积11.09万平方千米，海岸线总长1137千米，占福建省岸线总长的三分之一。沿海多天然良港，可兴建1~20万吨深水泊位的天然良港有100多个：福清湾、罗源湾、兴化湾久负盛名，是全国少有的深水港湾。东部沿海的海坛岛面积251.4平方千米，是福建省第一大岛，中国第五大岛。岛上的三十六脚湖，湖面积达2.1平方千米，是全省第一大天然淡水湖。其它较大的岛屿有南台岛、江阴岛、琅岐岛、粗芦岛、川石岛、大练岛等。淡水养殖鱼类有120种，海洋鱼类500余种。
