至2016年02月，新疆维吾尔自治区辖4个地级市、5个地区（注：3个自治区辖地区、2个自治州辖地区）、5个自治州，13个市辖区、22个县级市（注：9个自治区直辖县级市）、62个县、6个自治县。

　　乌鲁木齐市：天山区、沙依巴克区、新市区、水磨沟区、头屯河区、达坂城区、米东区、乌鲁木齐县

　　政府驻地：水磨沟区

　　克拉玛依市：独山子区、克拉玛依区、白碱滩区、乌尔禾区

　　政府驻地：克拉玛依区

　　吐鲁番市：高昌区、鄯善县、托克逊县

　　政府驻地：高昌区

　　哈密市：伊州区、伊吾县、巴里坤哈萨克自治县

　　政府驻地：伊州区

　　阿克苏地区：阿克苏市、温宿县、库车县、沙雅县、新和县、拜城县、乌什县、阿瓦提县、柯坪县

　　政府驻地：阿克苏市

　　喀什地区：喀什市、疏附县、疏勒县、英吉沙县、泽普县、莎车县、叶城县、麦盖提县、岳普湖县、伽师县、巴楚县、塔什库尔干塔吉克自治县

　　政府驻地：喀什市

　　和田地区：和田市、和田县、墨玉县、皮山县、洛浦县、策勒县、于田县、民丰县　

　　政府驻地：和田市

　　昌吉回族自治州：昌吉市、阜康市、呼图壁县、玛纳斯县、奇台县、吉木萨尔县、木垒哈萨克自治县

　　政府驻地：昌吉市

　　博尔塔拉蒙古自治州：博乐市、精河县、温泉县、阿拉山口市

　　政府驻地：博乐市

　　巴音郭楞蒙古自治州：库尔勒市、焉耆回族自治县、轮台县、尉犁县、若羌县、且末县、和静县、和硕县、博湖县　

　　政府驻地：库尔勒市

　　克孜勒苏柯尔克孜自治州：阿图什市、阿克陶县、阿合奇县、乌恰县

　　政府驻地：阿图什市

　　伊犁哈萨克自治州（副省级自治州）：伊宁市、奎屯市、霍尔果斯市、尼勒克县、伊宁县、霍城县、巩留县、新源县、昭苏县、特克斯县、察布查尔锡伯自治县、塔城地区（塔城市、乌苏市、额敏县、沙湾县、托里县、裕民县、和布克赛尔蒙古自治县）、阿勒泰地区（阿勒泰市、布尔津县、富蕴县、福海县、哈巴河县、青河县、吉木乃县）

　　政府驻地：伊宁市

　　直辖县级市：石河子市、阿拉尔市、图木舒克市、五家渠市、北屯市、铁门关市、双河市、可克达拉市、昆玉市